馬會為積極支持政府尋找控制疾病的長遠方法，於2003年捐款五億港元設立「衞生防護中心」。
2003年初沙士爆發，香港深受打擊。馬會捐款設立的「衞生防護中心」於2004年正式開幕，是全港首個專門預防和控制傳染病的機構。
